Le séquençage du génome du cannabis le plus complet jamais réalisé

Une avancée scientifique qui est passée quelque peu inaperçu : des chercheurs ont réalisé le séquençage le plus complet jamais effectué du génome du cannabis. La variété Pink Pepper, mise au point par des chercheurs sud-coréens et nord-américains, connait une couverture génomique de 99,6 %. Elle établit ainsi un nouveau standard pour l’étude de cette plante ancestrale. Ce progrès promet de révolutionner le développement de nouvelles variétés, car il dote les breeders, chercheurs et acteurs de l’industrie d’outils d’une précision sans précédent.

Le génome du cannabis Pink Pepper constitue à ce jour la carte génétique la plus aboutie du Cannabis sativa. Il surpasse largement toutes les tentatives antérieures de décodage de l’ADN de cette plante complexe. Avec ses 770 millions de paires de bases et plus de 30.000 gènes identifiés, ce séquençage marque un tournant majeur dans la compréhension moléculaire du cannabis.

Baptisée Pink Pepper en raison de sa teinte rose-violette caractéristique, cette variété a été développée par le professeur Jung Dae Lim et son équipe de l’Université nationale de Kangwon, en Corée du Sud, en partenariat avec l’Institute of Cannabis Research (ICR) du Colorado. Leurs résultats ont été publiés dans la prestigieuse revue Scientific Data de Springer Nature. 

Élaborée à partir de 26 variétés différentes de chanvre, la Pink Pepper affiche une forte concentration en cannabidiol (CBD) et une teneur réduite en tétrahydrocannabinol (THC) psychoactif, avec, pour particularité inattendue, une palette de couleurs allant du rose fuchsia au prune foncé.

Il s’agit là d’une percée majeure indéniable quand on sait que les séquençages antérieurs du cannabis présentaient d’innombrables lacunes. En 2011, la variété Purple Kush avait donné lieu à un premier séquençage partiel de 534 mégabases. 

Ce travail précurseur, bien qu’essentiel, restait limité en précision et souffrait de nombreuses lacunes. Depuis lors, plusieurs équipes ont tenté d’améliorer la cartographie du génome du cannabis, notamment à travers le projet Cannbio-2, sans toutefois atteindre le niveau de résolution atteint avec la Pink Pepper.

Ce résultat a été rendu possible grâce à l’utilisation de technologies de séquençage de troisième génération, capables de lire des régions répétitives et complexes du génome. Cette méthodologie a permis d’assembler 17 échafaudages chromosomiques dans la variété finale, surmontant ainsi les obstacles techniques des études précédentes. En outre, la publication libre de ces données via le Centre national d’information sur la biotechnologie (NCBI) constitue une ressource inestimable pour la communauté scientifique du monde entier.

Des implications majeures pour l’industrie du cannabis

Les retombées de cette avancée dépassent largement le cadre académique, tant elles pourraient transformer l’industrie même du cannabis. Pour les breeders et les généticiens, la Pink Pepper constitue désormais un génome du cannabis de référence fiable, ouvrant la voie à un développement plus ciblé et plus efficace de nouvelles variétés. Grâce à cette carte génétique détaillée, il devient possible de sélectionner avec précision des traits désirables, qu’il s’agisse de profils spécifiques de cannabinoïdes ou de terpènes, de résistance aux maladies ou encore d’adaptabilité à différents climats.

Dans le champ de la recherche médicale, ce séquençage quasi complet offre un levier inédit pour explorer les mécanismes moléculaires qui régissent la biosynthèse des cannabinoïdes. Les scientifiques peuvent désormais étudier finement la régulation des gènes impliqués non seulement dans la production de THC et de CBD, mais aussi dans celle de cannabinoïdes mineurs comme le cbg, le CBN ou le CBC, autant de composés aux propriétés thérapeutiques prometteuses. Cette connaissance accrue devrait accélérer la mise au point de variétés médicales taillées sur mesure pour des pathologies spécifiques et contribuer ainsi au développement de traitements à base de cannabis plus efficaces.

L’agriculture n’est pas en reste. L’accès à un génome du cannabis de référence complet permettra de créer des variétés de chanvre industriel mieux adaptées aux exigences de la production de fibres, d’huile ou de protéines, tout en renforçant leur tolérance à la sécheresse, aux maladies fongiques et aux divers aléas climatiques envisageables. Une telle résilience sera essentielle pour asseoir des cultures de cannabis à la fois durables et rentables à grande échelle.

Les liens de ce génome avec la Purple Kush

Quand on voit le temps et les efforts consacrés par les breeders et les scientifiques au séquençage du génome du cannabis, il est clair que le chemin jusqu’à l’obtention d’un modèle propre et complet n’a rien eu d’un long fleuve tranquille.

L’histoire du séquençage du génome du cannabis débuta véritablement en 2011, avec le travail pionnier réalisé sur la Purple Kush, une variété que Kannabia connaît bien, puisque c’est l’un des piliers de notre catalogue. Dirigé par une équipe de chercheurs canadiens, ce premier projet de séquençage marqua l’entrée du cannabis dans l’ère de la génomique moderne. Il mit notamment en évidence pour la première fois les différences moléculaires fondamentales entre les diverses variétés de Marijuana et de chanvre industriel.

Purple Kush x Black Domina

Purple Kush

Si vous cherchez une graine de cannabis qui vous procurera une expérience relaxante et agréable, la Purple Kush est le choix parfait pour vous. Grâce à ses presque 23 % de THC et à sa prédominance Indica, elle confère un effet relaxant et calme, qui ne vous fera pas vous sentir annulé mais plutôt calme et en paix.

L’étude originale sur la Purple Kush permit notamment d’identifier des expressions génétiques différenciées dans la biosynthèse des cannabinoïdes. Elle révéla que l’enzyme acide Δ9-tétrahydrocannabinolique synthase (THCA), responsable de la production de THC, était uniquement exprimée dans la Purple Kush, alors que dans des variétés de chanvre comme Finola, c’est l’enzyme CBDA synthase qui prenait le relais.

Une des hypothèses les plus fascinantes issues de cette recherche suggère que ces divergences pourraient être dues à l’action ancienne de virus. Ces pathogènes auraient infecté le cannabis il y a des millions d’années, insérant dans son ADN des séquences nouvelles qui auraient favorisé la duplication et la diversification des gènes de synthèse des cannabinoïdes. C’est notamment le cas du chromosome 6, dont les gènes THCA et CBDA synthase (responsables de la production de THC et CBD) sont entourés de fragments d’origine virale. Ce phénomène expliquerait pourquoi le chanvre (pauvre ne THC) et le cannabis psychoactif présentent des profils chimiques si différents, alors même qu’ils appartiennent à la même espèce (Cannabis sativa).

Pour Kannabia, ce lien historique avec la Purple Kush est loin d’être anecdotique : il incarne notre engagement constant envers l’innovation génétique et l’excellence dans le développement de nouvelles variétés. Notre Purple Kush reste fidèle à ses origines génétiques, celles-là même dont la richesse attire les scientifiques, avec une teneur en THC de 23 % et les nuances violettes emblématiques qui ont fait sa réputation.

Aujourd’hui, le lancement d’une nouvelle variété baptisée Zoap Rosé s’inscrit dans la droite ligne de notre travail sur les génétiques violettes. Fruit de l’hybridation d’une Rainbow Sherbet et d’une Pink Guava, cette variété à la légère dominance indica produit des fleurs spectaculaires aux teintes rosées.

Rainbow Sherbet x Pink Guava

Zoap Rosé : Un véritable joyau floral à portée de main !

La Zoap Rosé est un hybride à dominance indica (55/45), célèbre pour son profil terpénique floral et fruité aux notes de rose, fruits tropicaux et agrumes. Avec 18-22% de THC, ses effets allient stimulation mentale initiale et relaxation corporelle douce—parfaits pour égayer n’importe quel moment de la journée. Sa structure compacte et sa croissance vigoureuse la rendent idéale pour les cultures en espace réduit, tandis que ses têtes denses et ultra-résineuses sont parfaites pour les extractions. Une variété polyvalente pour les cultivateurs et consommateurs exigeants en quête de qualité supérieure et d’arômes sophistiqués.

À la tête de la révolution génomique du cannabis

La génétique est la base du cannabis. Et c’est uniquement à travers elle que nous pouvons comprendre les caractéristiques physiques et chimiques d’une plante au niveau moléculaire, et manipuler ses effets, sa qualité, son arôme, sa puissance, sa saveur, et bien plus encore.

Le séquençage complet du génome de Pink Pepper marque un moment décisif dans l’histoire du cannabis, comparable, par son importance, à celui du génome humain pour la médecine. Il ne fournit pas seulement des outils sans précédent pour la recherche et le développement, mais valide également le potentiel transformateur de la génomique appliquée au cannabis.

La mise à disposition publique de ce génome du cannabis démocratisera l’accès à des outils génomiques avancés, permettant à des chercheurs, des sélectionneurs et des entreprises de toutes tailles de contribuer à l’avancée de la science cannabique. L’avenir du cannabis est en train d’être réécrit au niveau moléculaire, et Pink Pepper a fourni l’alphabet génétique qui guidera cette transformation vers un horizon de possibilités illimitées pour cette plante extraordinaire.

Questions fréquentes sur le génome du cannabis

Qu’est-ce qui rend la séquençation du génome du cannabis Pink Pepper unique ?

La variété Pink Pepper possède le génome de cannabis le plus complet jamais séquencé, avec une couverture de 99,6 %. Ce résultat dépasse largement les travaux antérieurs et établit une nouvelle référence pour la recherche génétique sur le cannabis.

Pourquoi le génome du cannabis est-il si important pour les sélectionneurs et les chercheurs ?

Un génome complet du cannabis permet d’identifier des caractéristiques précises comme les profils de cannabinoïdes, la résistance aux maladies ou l’adaptabilité au climat, facilitant ainsi le développement de nouvelles variétés plus efficaces.

Quels sont les avantages pour la recherche médicale sur le cannabis ?

Le génome Pink Pepper aide les scientifiques à comprendre comment les gènes responsables de la production de THC, CBD et autres cannabinoïdes secondaires sont régulés, ouvrant la voie à des variétés thérapeutiques sur mesure.

Quelles technologies ont permis une telle précision dans la séquençation ?

Des technologies de séquençation de troisième génération ont été utilisées pour cartographier des zones complexes et répétitives de l’ADN, permettant la construction de 17 échafaudages chromosomiques très fiables.

Comment ce génome se compare-t-il à celui de variétés antérieures comme Purple Kush ?

Le génome de Purple Kush, séquencé en 2011, comportait de nombreuses lacunes. Pink Pepper marque une avancée majeure, offrant une carte génétique bien plus détaillée et exploitable du génome du cannabis.